底質(zhì)能記錄特定水環(huán)境的污染歷史，反映難降解物質(zhì)的積累情況，以及水體污染潛在的危險。底質(zhì)的性質(zhì)對水質(zhì)、水生生物有著明顯的影響，是天然水是否被污染及污染程度的重要標(biāo)志。

　　底質(zhì)檢測斷面的設(shè)置原則與水質(zhì)檢測斷面的設(shè)置原則相同但底質(zhì)受水文、氣象條件的影響較小，故采樣頻率遠(yuǎn)低于水樣，一般每年枯水期采樣一次，必要時可在豐水期采集一次。

　　底質(zhì)采樣量一般為1-2kg，如樣品不易采集或測定項目較少時，可予酌減。采集表層底質(zhì)樣品一般用挖式(或抓式)采樣器或錐式采樣器。前者適用于采樣量較大的情況，后者適用于采樣量較少的情況。管式泥芯采樣器用于采集柱狀樣品，以分析底質(zhì)中污染物質(zhì)的垂直分布情況。如果水域水深小于3m，可將竹竿粗的一端削成尖頭斜面，插入床底采樣。當(dāng)水深小于0.6m，可用長柄塑料勺直接采集表層底質(zhì)。